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華大基因研究院聯(lián)合中國水產(chǎn)科學(xué)研究院首次完成花鱸全基因組測序

 2019-05-22 12:03  來源: 互聯(lián)網(wǎng)   我來投稿 撤稿糾錯

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中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所和華大基因研究院聯(lián)合團隊利用NGS和Hi-C技術(shù)首次完成花鱸全基因組測序和精細(xì)圖譜繪制。

其基因組大小為668Mb,重復(fù)序列為132Mb,注釋基因為22015個。進化分析表明,花鱸與歐洲鱸魚關(guān)系最近,大概在8700萬年前開始分化,并且二者染色體間呈現(xiàn)較好的共線性。

花鱸有著珍貴的使用價值和藥用價值。古代詩人曾以“江上往來人,但愛鱸魚美”的詩句稱贊其體態(tài)和味道。在沿海一帶,產(chǎn)量較高,為產(chǎn)區(qū)的重要食用魚之一。其肉每百克含蛋白質(zhì)17.5克,脂肪3.1克,碳水化合物0.4克,熱量100千卡,鈣56毫克,磷131毫克,鐵1.2毫克,維生素B20.23毫克,煙酸1.7毫克和微量維生素B1。其鰓性味甘、平,有止咳化痰之功效,可用以治療小兒百日咳。其肉性味甘、溫,有健脾益氣之功效,常用于治療慢性胃痛、脾虛泄瀉、小兒疳積、消化不良、消瘦等癥;若手術(shù)后食用亦能促進傷口生肌愈合。

華大基因研究團隊和國家水產(chǎn)研究所通過比較基因組學(xué)分析,篩選到125個花鱸特異基因家族,可能與花鱸自身的特征密切相關(guān)。該研究可幫助深入理解花鱸的生命過程和進化特征,也為今后解析花鱸重要經(jīng)濟性狀,比如生長、抗病抗逆、性別、免疫等性狀的形成機制,建立基因組育種技術(shù)奠定了重要基礎(chǔ)。

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